Detecção de microrganismos e genes de degradação no ambiente

Qualquer processo que envolva a introdução de organismos em um ambiente, sejam eles geneticamente modificados ou não, requer o monitoramento e controle quantitativo dos genes que entraram naquele sistema. Os objetivos deste controle variam:

•  Verificar o desenvolvimento da população inserida no meio;
•  Analisar a disseminação de OGMs (Organismos Geneticamente Modifica-dos) e não-OGMs inseridos no meio;
•  Estudar o nível de transmissão de genes novos para populações nativas do ambiente;
•  Fornecer informações sobre o impacto causado pela adição de novas espécies ao meio, visto que elas podem tanto favorecer como prejudicar o desenvolvimento de populações micrbianas do próprio sítio.

Existem dois tipos básicos de estratégias experimentais para realizar este monitoramento:

• Métodos baseados em isolamento e cultivo: os microrganismos da amostra ambiental são isolados e armazenados em meios de cultivo seletivos e não-seletivos. Com isso, avalia-se o desenvolvimento de colônias. Tal procedimento deve respeitar protocolos convencionais de microbiologia, o que eleva os custos do procedimento.
• Métodos independentes-de-cultivo: a análise é feita a partir de células e/ou ácidos nucléicos provenientes da amostra.

Estes últimos são a preferência em casos onde a coleta ou manipulação de amostras é difícil (subsolos, aqüíferos profundos, resíduos industriais tóxicos) ou presença de toxinas no meio.

Além disso, apresentam a vantagem de determinar e monitorar especificamente o organismo, bem como os genes ligados ao processo de biorremediação.

Permite também a formação de um estoque genômico produzido a partir da clonagem de genes de interesse, amplificados por PCR, o que favorece análise filogenética futura de sequências de DNA e proteínas.

Referências:

Artigo “Biorremediação”, escrito por Christine Claire Gaylarde, Maria de Lourdes Bellinaso e Gilson Paulo Manfio em 2005.